La iglesia de Jesús de Machaca, ha sido levantada desde sus cimientos por los caciques Guarachi; interviniendo en la construcción de la iglesia maestros como Alonso Calli, natural del pueblo de Machaca, el albañil y cantero, Juan Quispe Guamán, nacido en el Cuzco y que habría participado en la construcción de otros recintos religiosos.
Fué concluida en 1706, su diseño el último momento de la arquitectura renacentista en la región andina. Ha sido construida en una sola nave en cruz latina y cúpula sobre el crucero; cuenta con bóvedas de crucería sobre el presbiterio y el coro. La torre data del año 1754 y el atrio de 1778. En el mismo año se reconstruyó la Capilla Miserere; sus portadas son de estilo clásico y gran parte de este conjunto ha sido concebido de manera libre.
En su interior se pueden observar cuadros pintados a principios del siglo XVIII por Juan Ramos, seguidor de la escuela de Leonardo Flores; también cuenta con una serie de cuadros de estilo manierista de autor anónimo.
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